Karya Buku:
Mengapa Vietnam Jatuh Seluruhnya ke Tangan Komunis, Yayasan FKIS-IKIP Yogyakarta 1975
Dinamika Islam, Shalahuddin Press, 1984)
Islam, Mengapa Tidak?, Shalahuddin Press, 1984
Percik-Percik Pemikiran Iqbal (bersama M. Diponegoro), Shalahuddin Press, 1984
Islam dan Masalah Kenegaraan, LP3ES, 1985
Peta Bumi Intelektualisme Islam di Indonesia, Mizan, 1993
Membumikan Islam, Pustaka Pelajar, Yogyakarta, 1995
Islam: Kakuatan Doktrin dan Kegamangan Umat, Pustaka Pelajar, Yogyakarta,1997
Islam dan Politik: Upaya Membingkai Peradaban, Pustaka Dinamika, Cirebon, 1999
Independensi Muhammadiyah di Tengah Pergumulan Pemikiran Islam dan Politik, Pustaka Cidesindo, Jakarta 2000
Indonesia (Menengok ke Belakang untuk Melangkah ke Depan), Gerakan Jalan Lurus, Jakarta, 2002
Mencari Autentisitas dalam Kegalauan, Pusat Studi Agama dan Peradaban (PSAP),Jakarta, 2004
Menggugah Nurani Bangsa, Maarif Institute for Culture and Humanity, Jakarta, 2005
Otobiografi Ahmad Syafii Maarif, Ombak, Jakarta, 2006
Islam, Good Governance dan Pengentasan Kemiskinan: Kebijakan Pemerintah,Kiprah Kelompok Islam dan Potret Gerakan Inisiatif di Tingkat Lokal, Maarif, A. Syafii ; Azra, Azyumardi ; Markus, Sudibyo, Maarif Institute; The Asia Foundation, Jaarta, 2007
Islam dalam Bingkai KeIndonesiaan dan Kemanusiaan, Sebuah Refleksi Sejarah,Mizan, Bandung, 2009
Penghargaan:
Magsaysay Award 2008
Habibie Award dalam bidang harmonisasi kehidupan beragama, 2010
Editor : M Taufik Budi Nurcahyanto